Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms