Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms