Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms