Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPIAP49247 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPIAP49247 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms