Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms