Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms