Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms