Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms