Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT2P45379 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT2P45379 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms