Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT4P35916 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT4P35916 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FLT4P35916 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FLT4P35916 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT4P35916 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms