Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPS1P31327 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPS1P31327 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPS1P31327 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms