Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms