Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TSPOP30536 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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