Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRMP28827 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
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