Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms