Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USF1P22415 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF1P22415 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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