Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCP2P22307 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCP2P22307 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCP2P22307 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2P22307 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2P22307 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2P22307 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2P22307 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms