Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms