Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTPRAP18433 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTPRAP18433 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTPRAP18433 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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