Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPEP16870 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CPEP16870 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CPEP16870 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms