Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSPP15924 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DSPP15924 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSPP15924 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSPP15924 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms