Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DMDP11532 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DMDP11532 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DMDP11532 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms