Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms