Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms