Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOP08100 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOP08100 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOP08100 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms