Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFNB1P01574 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms