Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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CLDN9O95484 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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