Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms