Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP104O60308 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP104O60308 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms