Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DENRO43583 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DENRO43583 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms