Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF208O43345 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms