Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CEP290O15078 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP290O15078 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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