Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SYNJ2O15056 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms