Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms