Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms