Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L9A6NEM1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms