Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNSTRNQ9Y448 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNSTRNQ9Y448 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms