Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms