Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms