Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNQ9UQP3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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