Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms