Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms