Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms