Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC23Q9UJX2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms