Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms