Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms