Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC17A6Q9P2U8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms