Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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