Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL28Q9NXS3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms