Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms